1938 m. apsigyveno Austrijoje, kurioje kartu su kitais iš Lietuvos pasitraukusiais dailininkais dalyvavo tarptautinėse karo pabėgėlių dailės parodose. 1949 m. su žmona išvyko į Pietų Afriką, apsigyveno Keiptaune. 1949–1965 m. intensyviai kūrė, dalyvavo parodose Pietų Afrikos Respublikoje, Rodezijoje (nuo 1980 m. – Zimbabvės Respublika), JAV, Kanadoje, Brazilijoje.
Mirė 1965 m. lapkričio 14 d. Keiptaune. Palaidotas Plumsteade kapinėse.
1966 m. pomirtine dailininko kūrybos paroda surengta PAR Nacionalinėje galerijoje Keiptaune.1976 m. PAR išleista pirmoji monografija apie dailininką.
1992 m. surengta pirmoji P. Domšaičio kūrybos paroda Lietuvoje – Lietuvos dailės muziejuje Vilniuje, vėliau perkelta į tuometinę LDM Klaipėdos paveikslų galeriją, kuriai suteiktas Prano Domšaičio galerijos vardas.
Vertingiausių dailininko darbų kolekciją 1982 m. įsigijo Lietuvių fondas (JAV), kuriuos perdavė 2001 m. Klaipėdoje atidarytai nuolatinei Prano Domšaičio kūrinių ekspozicijai dailininko vardo galerijoje.